Kemiavdelningen vid Linköpings universitet ger två egna kandidatprogram,Kemi-Molekylär design, 180 hp och Kemisk biologi, 180 hp samt ett högskoleingenjörsprogram Kemisk analysteknik, 180 hp och två masterprogram, Läkemedelskemi/Organisk syntes, 120 hp och Protein Science, 120 hp. Utöver detta deltar kemiavdelningen med kurser i ett antal andra program.

Kopplat till grundutbildningen bedrivs även  forskarutbildning inom organisk kemi, biokemi, oorganisk kemi samt fysikalisk kemi.

Kemiavdelningen ger dessutom kurser inom lärarutbildningen inriktningen kemi.